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一、现在高效财务管理内部控制中存在的问题
虽然内部控制对高校财务管理有很重要的作用，但是仍有不少的高校对其的重视程度不够，从而导致了财务管理内控制度不健全或执行不力，最后致使学校在资金管理方面出现严重问题和隐患。这些问题和隐患给高校内部不法分子贪污、挪用公款、非法侵占财产的行为带来了便利，为舞弊行为、甚至犯罪带来可乘之机。在高校财务管理领域发生的贪污犯罪案件中一般犯罪人都是单位负责人、财务负责人、或一般财务人员利用财务管理的漏洞，贪占、挪用甚至私分高校资金。这些问题的出现大多与财务管理内部控制不严、监督不到位有着直接的关系。现在虽然各个高校都已经开始重视内部控制制度的管理，但是仍然存在许多需要解决的问题。
1.高校财务管理的内部控制制度不健全
贪污、挪用公款等现象时有发生。这些年来，虽然一些高校按照财政部和教育部的相关要求建立了相关的内部会计控制制度，但因为缺乏相关的经验从而使得其缺乏科学性和合理性，而且原则性强，可操作性弱。存在着一些单位错误的把某些规章制度等同于内部控制制度，从而导致了内部控制制度不健全，甚至没有建立相应的自我防范、自我约束的内部控制制度和机制，致使财务控制存在许多漏洞，会计信息失真，财务管理秩序混乱。
2.高校内不发财务人员素质不够高
财务制度形同虚设，财务监督流于形式，各种政策得不到有效的实施。由于有些高校特别是新建高校的财务负责人缺乏管理经验，加之财务人员素质较低，财务规章制度不健全，内部会计控制制度难以有效发挥作用。有些规定多停留在文件或口头上，即使出了问题也总是大事化小，小事化了，内部控制制度形同虚设。财务监督是防止财务出现问题的最后一道关口，它的主要职能一般由上级主管部门或审计检察部门来执行。有一些高校的上级主管部门和审计监察部门很少对下级财务部门进行检查和监督，特别是一些民营高校更是缺少上级主管部门监督，致使个别高校的财务监督流于形式。
3.经济责任制内控管理水平不高。
由于高校财务管理存在漏洞，内控制度不完善，有不少高校相继出现经济方面的问题或案件。主要原因是对于财务管理制度的松弛，现金管理制度的不严格。有些高校经费报销不按审批程序办事，收入不入账，甚至设立账外账，为财务人员贪污和挪用公款提供了可乘之机。还有的高校随意扩大现金使用范围，增加了财务风险防范的难度。
最后高校的预算管理和审计水平急需提高。目前大部分的高校在预算方面都存在着一些问题。例如是财政布置的部门预算与学校内部综合预算无论是编制时间还是编制范围都不一致，学校需做两次预算。预算的执行上，没有建立相应的跟踪、分析和评价制度，对各部门的各项预算经费难以作出准确、具体的分析评价，对资金的使用效益也难以正确、完整的评价，目前，基本上只进行基本的、总括的分析评价。三是在预算执行的过程中还存在着预算内容不实、预算约束不强和预算执行不了等不良的情况。
二、关于加强高校财务管理内部控制的建议
建立完善的高校内部审计质量控制制度。高校内部审计机构应当建立继全各项规章制度并严格执行。建立对学校修缮工程、基建、后勤、政府采购、专项基金的监控机制。通过对学校修缮工程、基建工程的监督和审计，对工程规划、设计、报建、招标以及开工、施工、竣工、办理工程结算等各个环节进行有效监控，保障修缮及基建资金的投资效益，为学校节约资金；通过对后勤产业经营决策、经营效益进行审计，确保后勤社会化沿着正确的轨道顺利进行；通过对国家财政拨入的专项资金(如重点实验室、重点专业、重点学科建设资金以及高校迎接教学工作水平和管理水平评估投入的资金)进行审计，以确保专款专用，使专项工程达到预期要求。财务部门货币资金收支与记账的岗位应严格分离，即会计与出纳岗位严格分离，坚持“管账不管钱，管钱不管账”，特别是单位公章及校外银行储蓄存款或存折应由出纳以外的人保管。出纳人员不得兼任会计档案的保管和收人、支出、债权债务的登记工作；不能由一人办理货币资金的全过程；货币资金的收入、支出必须经过申请、审批、符合办理支付等合理合法程序；银行存款应月月同银行对账单核对；定期或不定期地对现金进行盘点，银行票据的办理要有一定权限和控制程序；要健全制约和检查制度。在高校的财务管理制度中建立严格的部门预算制度。我国预算管理制度中的一项根本改革就是部门预算改革，该项改革要求高校从预算编制开始的时候就严格按照部门预算的有关规定进行基本数据收集，根据高校的计划、高校的规模和定员定额的有关规定准确地编制部门预算，按照财政部门和主管部门批准的部门预算严格执行和有效控制，按照规范的程序进行预算调整。高校财务内部控制制度应当按照部门预算管理的要求，对高校预算编制、预算执行、预算调整以及收支核算管理及财务报表编报等进行重新规范，确保部门预算改革措施在高校的贯彻实施，有效防止部门预算与单位预算“两张皮”现象的再发生。建立规范合理的内部控制管理机制。做好固定资产管理工作必须坚持“制度管理，责任到人”的管理机制，管理机制应具备校级管理层、固定资产管理层、使用部门管理层，明确主管校长、学校资产管理处、财务部门等管理部门和使用部门的职责，建立起严格的管理责任体系。建立健全现金盘点和银行对账制度。出纳要自觉地进行经常性的对账工作。包括每日营业终了，将库存现金余额现金日记账核对相符，保证货币资金收付的正确性。出纳应当对其经手的货币资金的安全、完整负直接责任。同时，单位应重视对现金的盘点，要建立定期或不定期现金盘点制度。财务负责人或内部审计人员每季度至少要进行一次库存现金突击盘点，发现问题，要及时向学校领导报告或提出有关建议，确保高校货币资金内部控制正规高效。
