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大兴安岭湖通河野生五味子药用资源保护区地处大兴安岭林区的东南部，呼玛县境内，位于我国与俄罗斯的边境线上，紧邻黑龙江，地理位置为北纬51°24'30″到51°33'09″，东经126°41'55″到126°46'46″。在边境线以内(全部为国防林)，保护区内无大型厂矿区和居民区，受人为的干扰和破坏较轻。该区仅以一条黑龙江与俄罗斯隔江相望，动物可以通过江水或冰面在两国自由移动，交往频繁。该区的地理位置具有位于我国最北端的特殊性，对保护动植物资源具有特殊的国际意义。
1植被类型的多样性
大兴安岭湖通河野生五味子药用资源保护区地处大兴安岭东南部，气候较暖。又由于位于黑龙江江边的特殊地理位置，而受到黑龙江小气候的影响，该区植被类型丰富，是寒温带针叶林与温带阔叶林交错的地区，森林类型多样，生物多样性丰富。既有完整的从未受过破坏的各类型原始森林，又有一定面积的多种类型的草甸、湿地。
2物种的多样性
该区地处寒温带，具有寒温带物种的特点，紧邻黑龙江，又有了其特殊性，加之地处边境，相对破坏较轻，又可以在动物资源上与俄罗斯自然交流，所以该区物种丰富。既有典型寒温带的东西伯利亚植物区系的物种，也有东北植物区系的温带植物物种并存。共计有高等植物328种，其中属国家重点保护的植物物种有14种;鸟类有39科96种，兽类有8科18种，两栖类有3科3种，爬行类有2科3种，鱼类14科60种，国家Ⅰ级保护动物2种，其中兽类1种，鸟类1种。国家Ⅱ级保护动物15种，其中兽类2种，鸟类13种。省级重点保护动物21种，其中兽类4种，鸟类14种，爬行类1种，两栖类2种。大型真菌20科67种，昆虫8目61科271种。
3生态系统的稳定性
该区地处寒温带，其森林环境为自然形成的原生性森林。由于位于边境线上，人为破坏较轻，该区还存在较大面积的原始林。该区自然性强，物种丰富，结构稳定，群落复杂，人为干扰较少，具有较高的稳定性。
4生态系统的脆弱性
该区域由于位于寒温带，森林生长慢，林下存在多年岛状冻土层，多年冻土对大气温度升高和外界变化极为敏感，一旦遭到破坏，在冻土层上生长的各类型植物群落分布区域必将退缩。寒温带的植物群落的更新演替是一个十分漫长的过程，一经破坏必将演替成为以山杨、白桦等阳性阔叶树种为主体的次生群落，这些阔叶林若再经破坏，则形成榛子灌丛、胡枝子灌丛，兴安落叶松将更难以更新。生态环境必将遭到毁灭性的打击，系统将恢复到原来的顶级群落十分缓慢。因此该区生物群落对环境变化的适应能力是脆弱的，急需进行严格保护。
5保护区的面积适宜性评价
保护区的功能区的划分尽可能有利于保证生态系统的完整，使主要保护对象有适宜的生长条件与栖息环境。为了尽量减轻不良因素的干扰与破坏，核心区外围一定要有一定范围的缓冲地带，而且干扰强度大，干扰频度高的地段，缓冲带也应更宽一些。在划分功能区时，以自然地形、地势(如山脊线、河流等)的自然界限为主，适当结合行政、权属界限，尤其不得跨越省界。划分时还要便于管理，要协调好保护区的建设与各项事业的发展，要考虑对濒危野生动植物的拯救，科研与教学活动的开展，适于发展生态旅游与开展多种经营。因此，在交通方便之处与有些立地较好之处应划到保护区界外，或划到实验区中。
依据《中华人民共和国保护区条例》、《保护区建设项目标准》等有关规定，划分了该保护区的边界与各个功能区的范围。该区总面积7355hm2，其中核心区2877hm2，占总面积的39.12%;缓冲区面积2652hm2，占36.06%;实验区1826hm2，占24.82%。根据大兴安岭湖通河野生五味子药用资源保护区的性质，重点保护对象与功能区的划分，该保护区总体布局为:将保护区分为保护区域和经营区域。保护区域包括核心区和缓冲区。在此区域内不安排任何影响生态环境和生物多样性的建设内容，它是保护区的主体所在;经营区域是在实验区内，在该区域内进行必要的基础建设，旅游设施建设以及森林抚育管理与多种经营活动。该总体布局基本上解决了保护与发展的矛盾，既能有很好地保护，又能有一定的经济收益，使保护区能逐渐健康发展，实现规划目标。