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内部审计档案是内部审计部门辛勤劳动结果的最终见证，内部审计档案管理也是内部审计工作的重要组成部分。 认真做好内审档案的管理工作，可以更好的总结内审经验，提高内审质量，交流内审成果，研讨内审理论，同时也能为今后利用内审工作档案材料，提供完整而充分的原始资料。 一、内部审计档案管理主要包括以下四方面内容： 1．立项性文件材料。主要有：审计通知书；审计工作方案；审计项目委托协议书(授权或委托审计通知书)；单位自查报告；被审单位基本情况；上级机关对本项目审计的指示和意见。 2．证明性文件材料。主要有：被审计单位情况表；审计承诺函；审计证据(审计取证，旁证材料)；审计工作底稿；依法做出审计结论的法规目录或摘录；上级机关对本项目问题处理的政策界限。 3．结论性文件材料。主要有：内部审计报告；审计报告征求意见书；被审单位对审计报告提出的书面意见；有关审计项目的请示、报告、批复、批示等文件材料；审定审计报告的会议纪要；审计意见书；审计决定；被审单位执行审计意见或审计决定情况报告等。 4．其他备查文件材料。主要有：审计报告执行情况复查；新闻报道；项目工作总结或经验介绍；单位负责人有关档案资料等。 二、加强内审档案管理，应该重点做好以下五个方面工作 1.提高内审部门负责人的认识。提高认识是加强内审档案管理的前提。内审部门负责人应该本着对事业负责的精神，加强对内审档案管理工作的领导，在人员配备上，挑选素质高、责任心强的审计人员担任此重担。 2.制定规章制度，加强规范管理。内审部门所在的单位应该制定《内部审计档案管理办法》，使内部审计档案管理工作有章可依，促进企业内部审计达到制度化、科学化、规范化。 3.认真收集整理内审项目的审计资料。在审计过程中，所形成的审计通知、审计方案、审计工作底稿、审计证据、审计报告、被审计单位的反馈意见、审计结论和决定等，均是审计档案的原始资料。同时，部分外界材料也是审计档案保管的对象，如：外单位对被审单位的调查报告、新闻报道等。因此，在进行一个审计项目时，内部审计人员认真收集整理有关内审项目的各种审计资料。 4.认真抓好立卷归档工作。内审档案立卷归档要按照“谁审计，谁立卷”的基本原则，即由审计项目负责人立卷。在审计过程中，项目负责人要结合审计工作的具体分工，确定审计人员收集整理资料的范围内容，加以分析综合，形成立卷材料，按审计档案立卷规定的具体要求立卷归档，以确保审计档案质量。 内审档案一般按照所属单位（部门）立卷分类，然后再根据审计项目分类，如可以分成：财务收支审计类档案；经济责任审计类档案；建设工程审计类档案；专项调查审计类档案；授权及委托审计类档案等。 审计档案的立卷归档可以采用人工与微机相结合的办法。即：档案管理人员将应立卷的资料进行收集归类，然后分类进行编号输入档案管理软件。这样通过人工和微机相结合处理的审计档案，案卷既整齐规范，查找时一目了然，也为利用者提供了迅速、准确、快捷的查找方式。 5.做好内审档案管理的监督工作。内部审计档案的管理工作有较强的政策性、科学性和技术性，内部审计部门负责人要经常督促内审档案管理人员做好立卷归档工作，不断提高内审档案管理水平。
