PCR-ELISA在生物医学中的作用

PCR-ELISA在生物医学中的作用

本文作者:闫琳 王晓英 郭云昌 单位:中国疾病预防控制中心营养与食品安全所

PCR-ELISA是利用了PCR技术的高敏感性、核酸探针的特异性、酶标仪直接读取结果的客观性等优点建立的一项技术。PCR-ELISA只需要具备PCR仪和酶标仪即可实施,且其灵敏度及特异性均较高,下面就PCR–ELISA技术及其在国内外生物医学领域中的应用进行介绍。

1PCR-ELISA技术

聚合酶链反应(PCR)技术自诞生以来,在各个领域都得到了广泛的应用。传统对扩增产物检测的方法主要是凝胶电泳EB荧光显色法,以定性检测为主,只能粗略的相对定量,灵敏度低,易产生假阴性和假阳性结果,另外EB还具有致癌性。NIEMEYER等创建了应用固相捕获的PCR定量技术,即在PCR扩增以后借用酶联免疫吸附试验的原理,使用酶标抗体,通过杂固相或液相杂交来实现定量检测[1],被称为PCR-ELISA,它弥补了传统PCR检测方法的不足。该检测技术主要包括三个部分,分别为聚合酶链式反应(PCR)、扩增产物与探针的杂交及常规ELISA酶标显色[2]。通常PCR-ELISA技术需要借助生物素-链酶亲和素系统[3]。最初的PCR-ELISA采用夹心杂交法,包括捕获探针,扩增产物和检测探针,后经过改进,在PCR过程中给目的片段掺入标记物,使扩增的产物也具有检测探针的功效,即为直接杂交法。常规的PCR-ELISA只能作为一种定性试验,但若加入内标,做出标准曲线,也可达到定量检测的目的。

2在生物医学领域中的应用

2.1致病菌检测

PCR-ELISA用于致病菌的检测,通过PCR扩增、杂交及酶显色放大,使得该方法具有高的敏感性和特异性,而且应用96孔微孔板,可以同时检测多份样本,保证了检测的时效性和准确性,适于大量样本的筛选。国外对PCR-ELISA技术应用于致病菌的研究开展的较早,国内这方面的报道较少。在食物样本检测方面,PERELL等用PCR-ELISA法,检测205份鲜奶样本和300份牛肉馅样本中可编码志贺毒素的大肠埃希菌(STEC),检出率分别为21%和15%,结果表明,PCR-ELISA对食品原料中STEC高致病性血清群的快速检测有助于STEC食物中毒的危险性评估[4]。HONG等用PCR-ELISA检测禽肉中大肠弯曲菌,空肠弯曲菌和肠炎沙门菌,针对弯曲菌的ceuE基因和沙门菌的invA基因设计特异性探针,PCR扩增后用ELISA进行检测,比传统的电泳检测法敏感性提高了100~1000倍,最低可以检测到40CFU/ml弯曲菌和200CFU/ml沙门菌[5]。作者认为PCR-ELISA是一种快速高效的用于禽肉中沙门菌和弯曲菌检测和计数的方法。2009年,曹玮等建立了检测单核细胞增生李斯特菌hlyA基因的PCR-ELISA方法,并通过人工染菌牛奶样本,对其进行验证。结果证明该方法和细菌学上传统培养法的检出符合率为100%。经过12h前增菌,PCR-ELISA的检出限为1cfu/25ml牛奶样本,比电泳法敏感10~100倍,具有良好的敏感性,特异性和可靠性,认为这种方法将有助于提高食源性疾病的预警预报能力,增强检测方法的准确性[6]。在环境样本检测方面,KUO等以大肠菌群特异的16srRNA为探针,用PCR-ELISA法检测水样中的典型大肠菌群,检测时限4h,误差率为1.4%,总大肠菌群的检出限为5cfu/100ml水样[7]。对比研究显示PCR-ELISA法不论在时间,检出限和准确度上都优于目前的传统方法。Soheili采用PCR-ELISA方法检测工业冷凝水中的嗜肺军团菌,以16srRNA为目的片段,选用特异性引物进行巢氏PCR,带有DIG标记的PCR产物和生物素标记的探针杂交,通过POD标记的抗DIG抗体在显色反应中检测扩增产物。实验共检测了5份冷凝水样本,所有样本培养法和PCR-ELISA都检出阳性,与细菌培养方法相比,PCR-ELISA特异性更高,检测速度更快,作者认为该方法适用于工业冷凝水嗜肺军团菌污染的常规检测[8]。在致病菌临床样本检测方面,YAM等用单管生物素化的巢氏PCR-ELISA法,共检测659例结核杆菌的H37RvDNA,敏感性为97%,特异性为100%。对H37RvDNA进行系列稀释,当A405=0.6时,该方法的检出限为0.75cfu/每反应。结果表明PCR-ELISA是一种敏感性高、成本低廉的分子诊断方法,适用于结核病发病率高的发展中国家的临床诊断[9]。MOUSAVI等通过PCR扩增获得编码霍乱毒素B亚基的基因,采用PCR-ELISA法快速筛查伊朗南部产毒的霍乱弧菌O1菌株。结果表明,该方法具有较好的特异性和敏感性。检测限为0.5pg基因组DNA/每反应,即相当于5个菌细胞/每反应。实验证明PCR-ELISA检测霍乱弧菌O1菌株毒素基因更加快速和简便[10]。

2.2转基因食品检测

目前国外已经开发出用于检测转基因食品的PCR-ELISA试剂盒,我国也已建立了转基因食品(如大豆,水稻,鱼)的PCR-ELISA检测法。雷勃钧等用PCR-ELISA法对大豆品种进行了转基因的定性检测,灵敏度高达0.1%[11],足以达到欧盟1%检测阈值的要求。欧盟利用PCR技术对转基因玉米和大豆的35S启动子和NOS终止子进行水平测试时,检测灵敏度达到1%[12],而利用PCR-ELISA法对转基因大豆的检比欧盟推荐PCR方法提高5~10倍。陈茹等先针对转基因鱼中mMT启动子和hGH基因建立了Dig-PCR-ELISA方法,5μlPCR产物经1000倍稀释仍可以检测出,与常规PCR-电泳检测方法相比敏感性可提高至100~1000倍[13]。后来又针对转基因水稻中普遍存在的花椰菜花叶病毒(CaMV)35S启动子和胭脂碱合成酶NOS终止子(Tnos),建立了Dig–PCR-ELISA检测方法,可检测含量仅为0.1%的转基因样品,实现了半定量检测[14]。LAETITIA等以35S启动子或Bt176特异结合序列为目的片段的PCR-ELISA法筛选和检测面粉和淀粉类食物中的转基因Bt176玉米。结果表明这种方法是非常特异的,其敏感度和southern杂交相当,至少是凝胶电泳的6倍。用它来检测Bt176、Bt11、Mon810转基因玉米和抗草甘膦转基因大豆,灵敏度可以达到0.1%。作者认为PCR-ELISA是筛选鉴定面粉和天然淀粉中转基因Bt76玉米的一种可选方法,比起实时PCR更加便宜,在实验室监测中是非常有用的[15]。综上所述,在不同的转基因食品中用PCR-ELISA法,检测的灵敏度都达到了0.1%,远远超过了凝胶电泳法,超越倍数最高可达1000倍。

2.3病毒检测

目前国内外应用PCR-ELISA技术检测的病毒主要有肝炎病毒、肠病毒及禽流感病毒等。李稻等采用液相杂交技术,简化核酸杂交过程,建立乙肝病毒(HBV)PCR-ELISA方法,检测灵敏度达1×104拷贝/ml,大三阳标本的检出率为97.1%,小三阳标本的检出率为67.7%。故作者认为使用该技术可使实验操作简便、快速,适合临床实验室应用[16]。2006年,CHAHARAEIN等建立RT-PCR-ELISA法检测禽流感病毒亚型H9N2。对H9N2接种鸡的导管拭子样本连续稀释,用PCR-ELISA和传统的病毒细胞培养分离法分别进行检测,结果表明两者的检出限相似,并且PCR-ELISA法比PCR凝胶电泳法敏感性至少高10倍,因此作者认为该方法可用于检测鸡群中A型流感病毒,特别是H9N2亚型[17]。#p#分页标题#e#

2.4支原体检测

支原体是哺乳动物细胞培养中最常见的污染微生物。用PCR-ELISA法检测支原体污染,首先根据支原体16srDNA进化保守序列合成通用引物,进行PCR扩增,再通过探针杂交、ELISA检测,可以快速灵敏的对细胞悬液、贴壁细胞培养液上清、细胞培养基以及细胞培养基各组分等进行支原体污染分析。GARNER等比较了DNA染色、ELISA、PCR-电泳和PCR-ELISA这四种方法检测细胞培养液上的支原体污染情况。四种方法对污染细胞系和未污染细胞系的检测结果都具有可重复性,两种ELISA方法更易操作,结果更容易解释[18]。国内刘晋平等建立了检测兽用疫苗中支原体污染的PCR-ELISA技术,并应用于市售的疫苗样品,检出阳性率为35.6%,比PCR电泳法的检测率高11.2%。实验表明其最低检出模板浓度为9.7×10-2pg/ml,且模板量与ELISA检测结果具有良好的线性关系。这是首次将PCR-ELISA方法用于兽用疫苗中的检测[19]。除了上述介绍外,PCR-ELISA技术也在端粒酶检测[20-21],寄生虫检测[22-24],血型的基因分型[25],菌种鉴定等领域展开了应用,并取得了良好的效果。

3小结

PCR-ELISA技术具有较高的敏感性和特异性,国内外实验均表明PCR-ELISA较琼脂糖电泳敏感性高出10~100倍;另外酶标仪读出结果客观,主观干扰小;从DNA提取、PCR扩增、再到微孔板杂交显色、判断结果,最快可在一个工作日完成,所用时间短;一块微孔板上可以同时检测多份样品,实现高通量快速检测;试剂设备较为简单,成本低廉;所用试剂为常用的缓冲液,配置简便,所用仪器如酶标仪、PCR仪、温箱,是大多数实验室所具备的,有利于基层推广应用。该技术在PCR扩增之后又要进行ELISA反应,而后者是一个开放性的实验,特别是洗板,具有产生污染、引起假阳性的可能性;显色定量分析相对于最近的荧光探针分析,无论是灵敏度还是特异性上都有一定差距;另外操作步骤较繁琐,一定程度上制约了临床和现场的应用。相信随着自动化进样和洗板机的普及,这些可以得到一定程度的克服。